MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015850	GC	4	8	280751	280758	0 %	0 %	50 %	50 %	340781007
5002	NC_015850	GGC	2	6	280759	280764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781007
5003	NC_015850	GC	3	6	280771	280776	0 %	0 %	50 %	50 %	340781007
5004	NC_015850	CGG	2	6	280812	280817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781007
5005	NC_015850	GCG	2	6	280862	280867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781007
5006	NC_015850	GAC	2	6	280869	280874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781007
5007	NC_015850	CAT	2	6	280972	280977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781008
5008	NC_015850	TGGCAA	2	12	281083	281094	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781008
5009	NC_015850	CTC	2	6	281171	281176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781008
5010	NC_015850	TGC	2	6	281374	281379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5011	NC_015850	GCA	2	6	281380	281385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5012	NC_015850	CTG	2	6	281438	281443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5013	NC_015850	GCC	2	6	281451	281456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781008
5014	NC_015850	GCAGGC	2	12	281506	281517	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340781008
5015	NC_015850	GCT	2	6	281548	281553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5016	NC_015850	GCC	2	6	281664	281669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781008
5017	NC_015850	TGA	2	6	281815	281820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781008
5018	NC_015850	GCA	2	6	281857	281862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5019	NC_015850	CGT	2	6	281941	281946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5020	NC_015850	GCG	2	6	282027	282032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781008
5021	NC_015850	GGC	2	6	282043	282048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781008
5022	NC_015850	GC	3	6	282047	282052	0 %	0 %	50 %	50 %	340781008
5023	NC_015850	GCGA	2	8	282083	282090	25 %	0 %	50 %	25 %	340781008
5024	NC_015850	TGG	2	6	282100	282105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781008
5025	NC_015850	AGCG	2	8	282121	282128	25 %	0 %	50 %	25 %	340781008
5026	NC_015850	CTG	2	6	282155	282160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5027	NC_015850	GCA	2	6	282187	282192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5028	NC_015850	GCT	2	6	282233	282238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781008
5029	NC_015850	CTC	2	6	282293	282298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781008
5030	NC_015850	GCAATG	2	12	282309	282320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340781008
5031	NC_015850	ACCAGC	2	12	282336	282347	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340781008
5032	NC_015850	ATG	2	6	282351	282356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781008
5033	NC_015850	ACC	2	6	282375	282380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781008
5034	NC_015850	GCG	2	6	282588	282593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781009
5035	NC_015850	GTG	2	6	282620	282625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781009
5036	NC_015850	GCA	2	6	282642	282647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5037	NC_015850	GA	3	6	282648	282653	50 %	0 %	50 %	0 %	340781009
5038	NC_015850	GCA	2	6	282687	282692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5039	NC_015850	GGC	2	6	282703	282708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781009
5040	NC_015850	GCC	2	6	282725	282730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781009
5041	NC_015850	TGG	2	6	282732	282737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781009
5042	NC_015850	TGC	2	6	282767	282772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5043	NC_015850	CG	3	6	282795	282800	0 %	0 %	50 %	50 %	340781009
5044	NC_015850	CTG	2	6	282823	282828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5045	NC_015850	GAG	2	6	282895	282900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340781009
5046	NC_015850	GGT	2	6	282903	282908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340781009
5047	NC_015850	CGC	2	6	282940	282945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781009
5048	NC_015850	CGA	2	6	283011	283016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5049	NC_015850	CG	3	6	283019	283024	0 %	0 %	50 %	50 %	340781009
5050	NC_015850	CGG	2	6	283056	283061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781009
5051	NC_015850	GCCC	2	8	283067	283074	0 %	0 %	25 %	75 %	340781009
5052	NC_015850	CCA	2	6	283110	283115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781009
5053	NC_015850	CCG	2	6	283122	283127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781009
5054	NC_015850	GCA	2	6	283149	283154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5055	NC_015850	ACGGT	2	10	283157	283166	20 %	20 %	40 %	20 %	340781009
5056	NC_015850	CGG	2	6	283173	283178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781009
5057	NC_015850	GTT	2	6	283359	283364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340781009
5058	NC_015850	GCC	2	6	283429	283434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781009
5059	NC_015850	CGC	3	9	283435	283443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781009
5060	NC_015850	GCA	2	6	283531	283536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
5061	NC_015850	CGA	2	6	283548	283553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781009
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5063	NC_015850	TCCA	2	8	283781	283788	25 %	25 %	0 %	50 %	340781010
5064	NC_015850	GCA	2	6	283834	283839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781010
5065	NC_015850	CAGC	2	8	283855	283862	25 %	0 %	25 %	50 %	340781010
5066	NC_015850	GCG	2	6	283889	283894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781010
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5069	NC_015850	GCA	2	6	284122	284127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781010
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5071	NC_015850	CGG	2	6	284175	284180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781010
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5073	NC_015850	CAC	2	6	284240	284245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781010
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5080	NC_015850	TGC	2	6	284443	284448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781010
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5085	NC_015850	CGG	2	6	284769	284774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781011
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5091	NC_015850	GCAC	2	8	284945	284952	25 %	0 %	25 %	50 %	340781011
5092	NC_015850	TCG	2	6	284981	284986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781011
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5102	NC_015850	GCGG	2	8	285399	285406	0 %	0 %	75 %	25 %	340781012
5103	NC_015850	CGA	2	6	285413	285418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781012
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5105	NC_015850	GGGGC	2	10	285504	285513	0 %	0 %	80 %	20 %	340781012
5106	NC_015850	CGA	2	6	285550	285555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781012
5107	NC_015850	GCCAA	2	10	285570	285579	40 %	0 %	20 %	40 %	340781012
5108	NC_015850	CGC	2	6	285619	285624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781013
5109	NC_015850	GCC	3	9	285662	285670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781013
5110	NC_015850	CGG	2	6	285681	285686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781013
5111	NC_015850	G	7	7	285685	285691	0 %	0 %	100 %	0 %	340781013
5112	NC_015850	A	7	7	285857	285863	100 %	0 %	0 %	0 %	340781013
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5116	NC_015850	CAG	2	6	286027	286032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781013
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5119	NC_015850	CGT	2	6	286107	286112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781013
5120	NC_015850	CCG	2	6	286261	286266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781014
5121	NC_015850	CG	3	6	286296	286301	0 %	0 %	50 %	50 %	340781014
5122	NC_015850	CCG	2	6	286338	286343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781014
5123	NC_015850	GCA	2	6	286381	286386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781014
5124	NC_015850	GC	3	6	286397	286402	0 %	0 %	50 %	50 %	340781014
5125	NC_015850	CG	4	8	286417	286424	0 %	0 %	50 %	50 %	340781014
5126	NC_015850	GCT	2	6	286434	286439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781014
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5129	NC_015850	TGC	2	6	286621	286626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781014
5130	NC_015850	GAC	2	6	286691	286696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781014
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5132	NC_015850	GC	3	6	286722	286727	0 %	0 %	50 %	50 %	340781014
5133	NC_015850	GCC	2	6	286731	286736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340781014
5134	NC_015850	TGA	2	6	286747	286752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340781014
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5145	NC_015850	ATA	2	6	287232	287237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340781015
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5152	NC_015850	TGAA	2	8	287461	287468	50 %	25 %	25 %	0 %	340781015
5153	NC_015850	CCT	2	6	287489	287494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781015
5154	NC_015850	GC	3	6	287514	287519	0 %	0 %	50 %	50 %	340781015
5155	NC_015850	TTC	2	6	287541	287546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340781015
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5158	NC_015850	GC	3	6	287613	287618	0 %	0 %	50 %	50 %	340781015
5159	NC_015850	GC	3	6	287701	287706	0 %	0 %	50 %	50 %	340781015
5160	NC_015850	TCGATG	2	12	287758	287769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340781015
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5178	NC_015850	TA	3	6	288499	288504	50 %	50 %	0 %	0 %	340781016
5179	NC_015850	GCCA	2	8	288555	288562	25 %	0 %	25 %	50 %	340781016
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5194	NC_015850	CTG	2	6	289277	289282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781016
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5200	NC_015850	AGCCGC	2	12	289719	289730	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340781017
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5222	NC_015850	GCG	2	6	290604	290609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
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5225	NC_015850	GCAGG	2	10	290696	290705	20 %	0 %	60 %	20 %	340781019
5226	NC_015850	GCG	2	6	290799	290804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
5227	NC_015850	GCG	2	6	290895	290900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
5228	NC_015850	TCA	2	6	290977	290982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340781019
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5230	NC_015850	CGA	2	6	291016	291021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781019
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5232	NC_015850	CAG	2	6	291101	291106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781019
5233	NC_015850	TGC	2	6	291124	291129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781019
5234	NC_015850	CCA	2	6	291135	291140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781019
5235	NC_015850	GCAGGA	2	12	291160	291171	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	340781019
5236	NC_015850	ACCC	2	8	291200	291207	25 %	0 %	0 %	75 %	340781019
5237	NC_015850	GGC	2	6	291276	291281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
5238	NC_015850	CCA	2	6	291352	291357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781019
5239	NC_015850	ACC	2	6	291384	291389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340781019
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5241	NC_015850	A	6	6	291407	291412	100 %	0 %	0 %	0 %	340781019
5242	NC_015850	CGG	2	6	291415	291420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781019
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5351	NC_015850	GCCGC	2	10	295999	296008	0 %	0 %	40 %	60 %	340781022
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5357	NC_015850	TGCCGG	2	12	296316	296327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340781022
5358	NC_015850	TCCGCC	2	12	296341	296352	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	340781022
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5360	NC_015850	GC	3	6	296368	296373	0 %	0 %	50 %	50 %	340781022
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5485	NC_015850	GGC	2	6	301704	301709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
5486	NC_015850	CAG	2	6	301732	301737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
5487	NC_015850	GTC	2	6	301768	301773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781027
5488	NC_015850	CGA	2	6	301856	301861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
5489	NC_015850	CCTTGG	2	12	301965	301976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340781027
5490	NC_015850	CGG	2	6	301977	301982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340781027
5491	NC_015850	CAG	2	6	302065	302070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340781027
5492	NC_015850	CCT	2	6	302079	302084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340781027
5493	NC_015850	CACT	2	8	302089	302096	25 %	25 %	0 %	50 %	340781027
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